主要研究领域为新突发及重大传染病的流行特征研究与预测预警，旨在揭示疾病发生的社会因素、环境因素以及生物学机制，为公共卫生政策的制定和疾病预防控制策略的优化提供科学依据和数据支撑。围绕禽流感、手足口病、麻风、新冠感染等新发及重大传染病，深入研究病原溯源、基因组特征、传播与变异规律及流行特点，构建快速响应的风险评估和预测预警系统。近五年，获批国家级项目20项；代表性论文发表在Nature、Science、Cell、Lancet、Lancet Microbe、Nature Reviews Microbiology、Nature Communications等。获批国家发明专利7项，省部级以上奖励8项。
